كيف تحلل ملف VCF للجينوم الكامل مجانًا
أي ملف .vcf أو .vcf.gz للجينوم الكامل، من أي مختبر، تقدر تقراه مجانًا في متصفحك. وش في ملف VCF، والشيئين اللي يخربونه (rsID والإصدار)، ووش بيطلع لك.
تقدر تحلل أي ملف VCF للجينوم الكامل مجانًا في healthosx.com/ar/dna، من أي مختبر أو مستشفى. اختر ملف .vcf أو .vcf.gz (المضغوط عادي) ومتصفحك يقراه على جهازك، حتى لو حجمه كم جيجا. تطلع لك ملاحظات بلغة واضحة عن جينات الأدوية، عوامل الخطر الوراثية، الأكل والصفات، وما نرفع شي بشكل افتراضي. قصة حمضك النووي ما تبي حساب؛ التقرير الكامل يفتح في تطبيق HealthOS بعد كود يرسله لإيميلك.
خطوات تنزيل ملف الجينوم الكامل داخل الصفحة نفسها.
نفس الخطوات اللي تحت، جنب مكان رفع الملف — وتقدر تطلب إرسالها لك بالإيميل مع تذكير واحد.
وش في ملف VCF
بعد أسطر الهيدر (اللي تبدأ بـ ##)، كل سطر موضع تختلف فيه عن الجينوم المرجعي:
- CHROM وPOS: وين الموضع
- ID: رقم rsID إذا الملف فيه annotation، وإلا نقطة
- REF وALT: الحرف المرجعي وحرفك
- GT: الجينوتايب، مثل
0/1لنسخة وحدة أو1/1لنسختين
الجينوم الكامل فيه تقريبًا 4 إلى 5 مليون سطر. والملف يذكر الفروقات بس، فالموضع اللي مو موجود يا إنه مثل المرجع يا إنه ما انقرا، والملف لحاله ما يقول لك أيهم.
الشيئين اللي يخربون ملفات VCF
1. ما فيه rsID. مختبرات كثيرة تسلّم الملف وفيه . في كل عمود ID. الأدوات اللي تدوّر بالـ rsID ما تلقى شي. في /ar/dna تحليل الأصول يشتغل بالموقع (على GRCh37)، بس تقرير الصفات والصحة يحتاج rsID، وتضيفه بأداة bcftools annotate مع dbSNP.
2. إصدار الجينوم. المواقع تنقاس على GRCh37 (hg19) أو GRCh38 (hg38)، ونفس الرقم يعني مكان مختلف في كل واحد. ما نطابق ملف GRCh38 بدون rsID بالموقع، لأن النتيجة بتكون متغيرات غلط بثقة كاملة.
وين تلقى ملف VCF
- 1.سجّل دخولك عند شركة التسلسل وافتح قسم البيانات أو التنزيلات.
- 2.إذا طلع لك زر Unarchive اضغطه وانتظر لين تجهز الملفات.
- 3.نزّل ملف الـ VCF — اللي ينتهي بـ .vcf.gz (في Dante Labs اللي ينتهي بـ .snp.vcf.gz).
- 4.ارفع ملف .vcf.gz هنا مثل ما هو — بدون فك ضغط.
- بيوصلك: ملف متغيرات ينتهي بـ .vcf.gz (تقريبًا 100MB–1GB)
- كم ياخذ: دقايق — أو لين 48 ساعة إذا ملفاتك مؤرشفة
نزّل الـ VCF، مو ملفات FASTQ أو BAM أو CRAM. هذي قراءات الجهاز الخام — عشرات الجيجابايت — والتقرير المجاني يقرا الـ VCF. إذا ما عندك غير الـ BAM، محوّل BAM إلى VCF المجاني (healthosx.com/ar/dna/convert/bam-to-vcf) يستخرج نمطك الجيني من حوالي مليوني SNP معروفة في متصفحك. بعض الشركات روابطها تنتهي خلال دقيقة، فابدأ التنزيل على طول.
وش بيطلع لك
- أنت والأكل: سرعة تكسير الكافيين (CYP1A2)، هضم اللاكتوز (ومعه المتغير العربي مو بس الأوروبي)، احمرار الوجه مع الكحول، فيتامين د، الفولات، جينات السيلياك، ونقص G6PD (الفول).
- القلب والأيض: Lp(a)، تراكم الحديد (HFE)، وحساسية الملح.
- الأدوية: CYP2C19 وCYP2C9 وVKORC1 وSLCO1B1 (الستاتين) وTPMT وDPYD، ومؤشرات HLA لتحسس بعض الأدوية. هذي أكثر نتائج تستاهل تقولها لطبيبك أو الصيدلي مرة وحدة.
- صفاتك: لون العيون والشعر، النمش، نوع شمع الأذن، فصيلة الدم.
ملاحظة عن اللغة: واجهة الصفحة وخطوات التنزيل بالعربي، لكن نصوص النتائج نفسها حاليًا بالإنجليزي. واسأل حمضك النووي يجاوبك بالعربي، فتقدر تسأله عن أي نتيجة وتفهمها بلغتك.
مع الجينوم الكامل يقرا التقرير بعد LRRK2 G2019S وTTR V122I وجينات التنكس البقعي (CFH وARMS2)، ويقدر يحدد فصيلة O من المرجع.
باختصار: وش يستاهل تسوي له شي.
اسأل حمضك النووي: 5 أسئلة مجانية عن نتائجك.
| اللي تبيه | من هذا الملف | ليش |
|---|---|---|
| الصفات والأكل والشرب | نعم | اللاكتوز، الكافيين، احمرار الكحول، فيتامين د، الفولات |
| جينات الأدوية | نعم | CYP2C19 وCYP2C9 وVKORC1 وSLCO1B1 وTPMT وDPYD ومؤشرات HLA-B |
| CYP2D6 (الكودين، الترامادول) | لا | يحتاج قراءة عدد نسخ الجين، وبيانات الـ SNP ما تسويها |
| تحليل الأصول | نعم | 15 منطقة مقابل 157 مجموعة مرجعية، وأقرب مجموعة من 298 مجموعة و 133 مجموعة قديمة |
| هابلوغروب خط الأم/الأب | جزئيًا | الجينوم الكامل يغطي تقريبًا كل المواضع، فيوصل أعمق |
| متغيرات الأمراض النادرة | جزئيًا | تغطية حقيقية، بس هذا فحص مو تشخيص — أكّد في مختبر معتمد |
| إيجاد الأقارب | لا | يحتاج قاعدة بيانات لناس ثانيين: GEDmatch أو MyHeritage أو FamilyTreeDNA |
Scroll the table sideways for the rest →
كل شي يُقرأ في متصفحك، ما عدا الأصول: إذا وافقت، يُرسل بس الماركرات اللازمة وتنحفظ مع نتيجتك لين تحذفها.
الخصوصية: التقرير يُقرا في متصفحك، والملف يبقى في جهازك إلا إذا اخترت تحفظه. الأصول اختيارية وتحتاج سيرفر عشان نقارنك مع 157 مجموعة مرجعية، فنرسل بس الواسمات الجينية اللي نحتاجها، وتنحفظ مع نتيجتك لين ما تحذفها. اسأل حمضك النووي شات اختياري: أول 5 أسئلة ببلاش، وبعدين $1 لكل 5 أسئلة، ويحفظ ملفك (مشفّر، وتقدر تحذفه متى ما تبي) بس إذا اخترت أنت.
أدوات مجانية ثانية لملف VCF حقك
- محوّل VCF إلى 23andMe: بعض أدوات البيانات الخام ما تقبل إلا ملف نصي على طريقة 23andMe. هذي الأداة تكتب لك كل SNP موجود في الـ VCF ومعه rsID على شكل rsid والكروموسوم والموقع والتركيب الجيني، في متصفحك، كملف .txt أو .zip.
- مكتشف الهابلوغروب: هابلوغروب الأم، وإذا عندك كروموسوم Y فهابلوغروب الأب، من نفس ملف الـ VCF.
- فاحص ملف الـ DNA: نسخة البناء، والـ rsIDs، والضغط، وليش أداة ثانية رفضت الملف.
اختر ملف VCF حقك واقراه في متصفحك: healthosx.com/ar/dna
جديد على ملفات DNA الخام؟ ابدأ بالدليل الكامل: كيف تحلل ملف 23andMe الخام مجانًا
أسئلة متكررة
- فيه أداة مجانية تحلل ملف VCF.gz للجينوم الكامل؟
- إيه. healthosx.com/ar/dna يقرا ملف .vcf.gz أو .vcf للجينوم الكامل من أي مختبر بدون ما تفك ضغطه، حتى الملفات اللي حجمها قيقابايت من Nebula وDante Labs وSequencing.com، ويحولها لملاحظات بلغة واضحة عن جينات الأدوية وعوامل الخطر الوراثية والأكل والصفات. مجانًا: الملف يُقرا في متصفحك، وقصة حمضك النووي تنفتح على طول بدون حساب. التقرير الكامل ينفتح في تطبيق HealthOS بعد كود من 6 أرقام يرسله لإيميلك، وملفك يبقى في جهازك.
- أقدر أعرف أصولي من ملف VCF للجينوم الكامل؟
- إيه، في healthosx.com/ar/dna، لو اخترت هالخيار. تحليل الأصول هو الخطوة الوحيدة اللي تشتغل على سيرفر: ترسل قائمة واسمات من ملفك، مو الملف نفسه، لـ HealthOS في ألمانيا وتقارنها بلوحة مرجعية. ملف VCF بدون rsIDs يشتغل للأصول لو كان على GRCh37؛ لكن الملاحظات الصحية تحتاج rsIDs.
- ليش أدوات الـ DNA ترفض ملف الـ VCF حقي؟
- غالبًا عشان ما فيه rsIDs (نقطة في عمود الـ ID)، فالأدوات اللي تدور على المتغيّرات بالـ rsID ما تلقى شي، أو لأن الملف على GRCh38 والأداة تتوقع GRCh37. أمر bcftools annotate ضد dbSNP يضيف لك الـ rsIDs.
ما عندك ملف DNA خام بعد؟
اطلب طقم HealthOS للـ DNA: ابصق في الأنبوب في بيتك، وأصولك وسلالاتك وصفاتك توصل حسابك في HealthOS مع الملف الخام.
شوف طقم الـ DNAكتابة
فريق أبحاث HealthOS