محوّل VCF مجاني
حوّل الـ VCF حقك لصيغة 23andMe
بعض أدوات DNA الخام ما تقبل إلا ملف نصي على طريقة 23andMe. ارمِ ملف .vcf أو .vcf.gz للجينوم كامل ونزّل أنماطك الجينية كـ rsid، الكروموسوم، الموقع والنمط الجيني، نفس تنسيق 23andMe. ملف الـ VCF حقك لازم يكون فيه rsIDs في عمود ID.
التحويل يصير كله في متصفحك. ملفك ما يُرفع أبدًا، ما فيه حساب، وكله ببلاش. نحسب إن التحويل اشتغل ونتيجته، مثل “GRCh37, converted”، بس ما نحسب الملف نفسه ولا اسمه ولا أي نمط جيني فيه.
اختر أو ارمِ ملف الـ VCF حقك
.vcf · .vcf.gz · .zip
يمكن ما تحتاج تحويل أصلاً
تقرير DNA المجاني في /dna يقرا ملف VCF للجينوم الكامل مباشرة: جينات الأدوية، عوامل الخطر الوراثية، الصفات، الأصول، والخطين العائليين. قصة DNA مالك تنفتح على طول بدون حساب؛ والتقرير الكامل ينفتح بعد كود يرسل لإيميلك.
وش يسوي المحوّل
- يكتب سطر لكل SNP يذكره الـ VCF مالك وله rsID: الـ rsID، والكروموسوم (1–22، X، Y أو MT)، والموقع، والحرفين مالك، أو حرف واحد إذا الـ VCF فيه قراءة واحدة مثل كروموسوم Y عند الرجال.
- يتجاوز الإدخالات والحذوفات والمتغيّرات الهيكلية (ملف على طريقة 23andMe ياخذ حروف مفردة بس)، والسطور اللي قارئ المتغيّرات علّمها إنها مو موثوقة، وأي شي خارج الكروموسومات الأساسية.
- ينسخ المواقع كما هي ويقول لك على أي نسخة بناء جينوم. لا يضيف rsIDs ولا يحوّل بين النسخ.
- يقرا .vcf و .vcf.gz، بما فيها ملفات BGZF اللي يكتبها bcftools و GATK، بأي حجم يقدر المتصفح يبثه.
أسئلة
كيف أحول ملف VCF للجينوم الكامل لصيغة 23andMe؟
اسحب ملف .vcf أو .vcf.gz على healthosx.com/dna/vcf-to-23andme. بيكتب كل SNP يذكره الـ VCF مالك وله rsID على شكل rsid وكروموسوم وموقع وجينوتايب، نفس ترتيب البيانات الخام في 23andMe، ويرجعه لك كـ .txt أو .zip. يشتغل في متصفحك: مجاني، بدون حساب، والملف ما يُرفع أبدًا.
الـ VCF مالي ما فيه rsIDs. أقدر أحوله؟
مو هنا: ملف على طريقة 23andMe يعتمد على rsID. علّم الـ VCF ضد dbSNP أول، بـ bcftools annotate -c ID وملف dbSNP على نفس نسخة البناء الجينومي، وبعدين حوّل النتيجة. التقرير المجاني في healthosx.com/dna يقرا جينوم كامل غير معلّم عشان الأصول بدون ما تحوله.
ليش الملف المحوّل سطور أقل من الـ VCF مالي؟
يحتفظ بس بالتغييرات اللي بحرف واحد (SNPs) واللي عندها rsID. الإدراجات، والحذف، والمتغيّرات التركيبية، والصفوف اللي حدّدها برنامج قراءة المتغيّرات، والـ contigs اللي خارج الكروموسومات الأساسية كلها تنحذف، والصفحة تحسب لك كل وحدة فيها.
هل الملف المحوّل يعرض الأماكن اللي أطابق فيها المرجع؟
بس اللي ملف VCF عندك يعرضه. ملف VCF للجينوم الكامل عادةً يعرض الأماكن اللي تختلف فيها عن المرجع، فالمحوّل يسوي نفس الشي. أما gVCF أو VCF لكل المواقع يعرض كمان الأماكن اللي تطابق، وهذي تنكتب بحروف المرجع.
على أي نسخة جينوم يطلع الملف؟
نفس نسخة الـ VCF عندك: المواقع تننسخ مو تتحوّل. ملفات 23andMe على GRCh37، فأي أداة تطابق حسب الموقع تبي VCF على GRCh37؛ أما الأدوات اللي تدور الواسمات الجينية بالـ rsID تشتغل في الحالتين.
هل جينومي ينرفع؟
لا. الملف يقرا ويتحوّل داخل متصفحك، والتحميل يصير على جهازك.
أقدر أحوّل ملف BAM أو CRAM لصيغة 23andMe؟
مو مباشرة. ملفات BAM و CRAM فيها قراءات التسلسل المصفوفة عندك، مو قائمة بالأنماط الجينية. استخراج المتغيّرات (عن طريق bcftools أو GATK) يحوّلها لـ VCF أول، وأغلب المختبرات تقدر تصدّر لك VCF لو طلبت. بعدها حوّل الـ VCF هنا.
وين أقدر أستخدم الملف بعد التحويل؟
في الأدوات اللي مبنية لملفات شرائح التنميط الجيني، لأنها تتوقع تنسيق 23andMe. قبل لا ترفعه على GEDmatch أو Read Your DNA أو أي موقع ثاني، تأكّد من شروط الحجم والتنسيق الحالية عندهم: الجينوم الكامل المحوّل فيه ملايين الصفوف، أكثر بوايد من ملف الشريحة، وملف VCF مبني على GRCh38 بيعطيك إحداثيات GRCh38. وما تحتاج تحوّل عشان healthosx.com/dna، لأنه يقرأ الـ VCF مباشرة.