كيف تحلل ملف VCF من Nebula Genomics
Nebula تعطيك ملفات FASTQ وCRAM وVCF. وحدة بس منها هي اللي تقراها أدوات الـ DNA. أي ملف تنزّل، ليش ينرفض أحيانًا، وكيف تقراه مجانًا في متصفحك.
عشان تحلل بيانات Nebula Genomics، نزّل ملف الـ VCF (اللي ينتهي بـ .vcf.gz)، مو FASTQ ولا CRAM، واختاره في healthosx.com/ar/dna. متصفحك يقرا حتى ملف بحجم كم جيجا على جهازك، ويطلع لك نتائج عن الأكل والأدوية والقلب وصفاتك. ببلاش، والملف ما يرتفع عشان نعرض قصتك أو تقريرك. قصة حمضك النووي ما تبي حساب؛ التقرير الكامل يفتح في تطبيق HealthOS بعد كود من 6 أرقام يرسله لإيميلك.
Nebula (اسمها الحين DNA Complete) تسوي تسلسل للجينوم الكامل، يعني بياناتك أغنى بكثير من ملف 23andMe. المشكلة إنها توصلك كذا ملف، واختيار الملف الغلط أكثر سبب لفشل الأدوات.

خطوات تنزيل ملف الجينوم الكامل داخل الصفحة نفسها.
نفس الخطوات اللي تحت، جنب مكان رفع الملف — وتقدر تطلب إرسالها لك بالإيميل مع تذكير واحد.
أي ملف تنزّل
- FASTQ: القراءات الخام من الجهاز. عشرات الجيجابايت، وما فيه أداة استهلاكية تقراها.
- CRAM (و.crai): نفس القراءات بس مرتبة على الجينوم المرجعي. برضو عشرات الجيجا، وهي لبرامج المعلوماتية الحيوية.
- VCF (.vcf.gz): قائمة المواضع اللي تختلف فيها عن المرجع. هذا اللي تبيه.
كيف تنزّله
- 1.سجّل دخولك عند شركة التسلسل وافتح قسم البيانات أو التنزيلات.
- 2.إذا طلع لك زر Unarchive اضغطه وانتظر لين تجهز الملفات.
- 3.نزّل ملف الـ VCF — اللي ينتهي بـ .vcf.gz (في Dante Labs اللي ينتهي بـ .snp.vcf.gz).
- 4.ارفع ملف .vcf.gz هنا مثل ما هو — بدون فك ضغط.
- بيوصلك: ملف متغيرات ينتهي بـ .vcf.gz (تقريبًا 100MB–1GB)
- كم ياخذ: دقايق — أو لين 48 ساعة إذا ملفاتك مؤرشفة
نزّل الـ VCF، مو ملفات FASTQ أو BAM أو CRAM. هذي قراءات الجهاز الخام — عشرات الجيجابايت — والتقرير المجاني يقرا الـ VCF. إذا ما عندك غير الـ BAM، محوّل BAM إلى VCF المجاني (healthosx.com/ar/dna/convert/bam-to-vcf) يستخرج نمطك الجيني من حوالي مليوني SNP معروفة في متصفحك. بعض الشركات روابطها تنتهي خلال دقيقة، فابدأ التنزيل على طول.
إذا انرفض ملفك
افتح الملف وشوف العمود الثالث (ID) في أول أسطر البيانات. إذا كل الأسطر فيها نقطة (.)، ملفك ما فيه أرقام rsID، وأغلب الأدوات تدوّر بالـ rsID فترجع فاضية.
- تحليل الأصول يشتغل إذا الملف على GRCh37، لأنه يطابق بالموقع. وإذا كان على GRCh38 وبدون rsID نرفضه بدل ما نعطيك نتيجة غلط وواثقة.
- نتائج الصفات والصحة تحتاج rsID. الحل تعمل annotation للملف مع dbSNP، مثلًا بأداة
bcftools annotate.
تبي ملف VCF حقك يصير مثل ملفات 23andMe عشان أداة ما تقبل غيرها؟ حوّله مجانًا في متصفحك. ومثل تقرير الصفات، المحوّل يبغى rsIDs في عمود الـ ID. ونفس الـ VCF يعطيك هابلوغروبات الأم والأب، وفاحص الملفات يقرأ لك نسخة البناء والـ rsIDs.
وش بيطلع لك
- أنت والأكل: سرعة تكسير الكافيين (CYP1A2)، هضم اللاكتوز (ومعه المتغير العربي مو بس الأوروبي)، احمرار الوجه مع الكحول، فيتامين د، الفولات، جينات السيلياك، ونقص G6PD (الفول).
- القلب والأيض: Lp(a)، تراكم الحديد (HFE)، وحساسية الملح.
- الأدوية: CYP2C19 وCYP2C9 وVKORC1 وSLCO1B1 (الستاتين) وTPMT وDPYD، ومؤشرات HLA لتحسس بعض الأدوية. هذي أكثر نتائج تستاهل تقولها لطبيبك أو الصيدلي مرة وحدة.
- صفاتك: لون العيون والشعر، النمش، نوع شمع الأذن، فصيلة الدم.
ملاحظة عن اللغة: واجهة الصفحة وخطوات التنزيل بالعربي، لكن نصوص النتائج نفسها حاليًا بالإنجليزي. واسأل حمضك النووي يجاوبك بالعربي، فتقدر تسأله عن أي نتيجة وتفهمها بلغتك.

باختصار: وش يستاهل تسوي له شي.

اسأل حمضك النووي: 5 أسئلة مجانية عن نتائجك.
| اللي تبيه | من هذا الملف | ليش |
|---|---|---|
| الصفات والأكل والشرب | نعم | اللاكتوز، الكافيين، احمرار الكحول، فيتامين د، الفولات |
| جينات الأدوية | نعم | CYP2C19 وCYP2C9 وVKORC1 وSLCO1B1 وTPMT وDPYD ومؤشرات HLA-B |
| CYP2D6 (الكودين، الترامادول) | لا | يحتاج قراءة عدد نسخ الجين، وبيانات الـ SNP ما تسويها |
| تحليل الأصول | نعم | 15 منطقة مقابل 157 مجموعة مرجعية، وأقرب مجموعة من 298 مجموعة و 133 مجموعة قديمة |
| هابلوغروب خط الأم/الأب | جزئيًا | الجينوم الكامل يغطي تقريبًا كل المواضع، فيوصل أعمق |
| متغيرات الأمراض النادرة | جزئيًا | تغطية حقيقية، بس هذا فحص مو تشخيص — أكّد في مختبر معتمد |
| إيجاد الأقارب | لا | يحتاج قاعدة بيانات لناس ثانيين: GEDmatch أو MyHeritage أو FamilyTreeDNA |
Scroll the table sideways for the rest →
كل شي يُقرأ في متصفحك، ما عدا الأصول: إذا وافقت، يُرسل بس الماركرات اللازمة وتنحفظ مع نتيجتك لين تحذفها.
الخصوصية: التقرير يُقرا في متصفحك، والملف يبقى في جهازك إلا إذا اخترت تحفظه. الأصول اختيارية وتحتاج سيرفر عشان نقارنك مع 157 مجموعة مرجعية، فنرسل بس الواسمات الجينية اللي نحتاجها، وتنحفظ مع نتيجتك لين ما تحذفها. اسأل حمضك النووي شات اختياري: أول 5 أسئلة ببلاش، وبعدين $1 لكل 5 أسئلة، ويحفظ ملفك (مشفّر، وتقدر تحذفه متى ما تبي) بس إذا اخترت أنت.
مع الجينوم الكامل، اسأل حمضك النووي يقدر يروح أبعد إذا حفظت ملفك: درجات متعددة الجينات وأي متغيّر تسأل عنه. أما هابلوغروبات الأم والأب ما تبغى شي من هذا: مكتشف الهابلوغروب المجاني يقرأها من نفس الـ VCF في متصفحك.
اختر ملف VCF حقك واقراه الحين: healthosx.com/ar/dna
جديد على ملفات DNA الخام؟ ابدأ بالدليل الكامل: كيف تحلل ملف 23andMe الخام مجانًا
أسئلة متكررة
- وش أقدر أسوي بملف VCF حقي من Nebula Genomics؟
- اقراه مجانًا في healthosx.com/ar/dna: جينات استقلاب الأدوية مثل CYP2C19، وعوامل الخطر الوراثية، وشوية متغيّرات لحالة الحامل، والأكل والصفات، وتقدر تشوف تفصيل اختلاط الأصول في 15 منطقة ومجموعتك الأمومية والأبوية. يقرأ ملف .vcf.gz على GRCh37 أو GRCh38 حتى لو حجمه قيقا بايتات. وكله ببلاش: الملف ينقرا في متصفحك، وقصة حمضك النووي تفتح لك على طول بدون حساب. التقرير الكامل يفتح في تطبيق HealthOS بعد كود من 6 أرقام يرسله لإيميلك، وملفك يبقى في جهازك. الملاحظات الصحية تحتاج rsIDs في خانة ID. وتقدر تحوّل الـ VCF لصيغة 23andMe في healthosx.com/ar/dna/vcf-to-23andme، وخلّ الـ CRAM عندك عشان تعيد التحليل بعدين.
- ليش انرفض ملف DNA حقي يوم رفعته؟
- غالبًا لسبب من ستة: اخترت تقرير بدل البيانات الخام، أو التحميل ما خلص، أو الضغط مو من النوع اللي المتصفح يقراه، أو ملف VCF للجينوم الكامل ما فيه rsIDs، أو الملف على نسخة جينوم (GRCh37 أو GRCh38) غير اللي الأداة تتوقعها، أو اخترت BAM أو CRAM أو FASTQ بدل VCF. أداة فحص الملفات المجانية في healthosx.com/ar/dna/check تقول لك السبب والحل. تقرأ الملف في متصفحك، ما ترفع شي وما تطلب حساب.
- أفحص ملف VCF حقي من Nebula مقابل ClinVar؟
- الجينوم الكامل هو الملف اللي فيه فحص ClinVar له معنى، لأن المتغيّرات النادرة فعلاً تنقرا. أداة Ensembl VEP تشرح كل متغيّر وتأثيره على الجين وسجلاته المعروفة في ClinVar؛ مجانية بس مبنيّة للباحثين. أي نتيجة تقول “مُمرِض” لا تعتبرها مؤكدة لين ما يفحصها مختبر معتمد.
- أي ملف من Nebula أستخدم: VCF ولا CRAM ولا BAM ولا FASTQ؟
- ملف VCF (.vcf.gz) تقريبًا لكل الأدوات. FASTQ هو القراءات الخام، وCRAM أو BAM هي القراءات المصفوفة، وكل واحد فيها عشرات الجيجابايت ومبني لبرامج المعلوماتية الحيوية. خلك حافظ نسخة من CRAM: هو الملف الوحيد اللي يخليك تستدعي متغيّراتك مرة ثانية بعدين.
ما عندك ملف DNA خام بعد؟
اطلب طقم HealthOS للـ DNA: ابصق في الأنبوب في بيتك، وأصولك وسلالاتك وصفاتك توصل حسابك في HealthOS مع الملف الخام.
شوف طقم الـ DNAكتابة
فريق أبحاث HealthOS