وش معنى TPMT وNUDT15 في ملف 23andMe الخام؟
TPMT وNUDT15 جينات تظهر نتائجها كأسطر rsID في البيانات الخام، وليست تشخيصًا، وأي متغير منخفض النشاط قد يزيد خطر السمية مع جرعات الثيوبورين العادية.
لو شفت في ملف 23andMe الخام اسم TPMT، فهو اسم جين يظهر على شكل أسطر نمط وراثي بصيغة rsID، مو تشخيص. أهميته تتعلق أساسًا بأدوية الثيوبورين مثل azathioprine و6-mercaptopurine وthioguanine. أي متغير منخفض النشاط في TPMT أو NUDT15 قد يرفع خطر نقص خلايا الدم مع الجرعات الابتدائية العادية. نقص خلايا الدم يعني أن نشاط نخاع العظم ينخفض، وهذا قد يؤدي إلى عدوى أو نزيف.
لا تغيّر الجرعة بنفسك. إذا شفت أليل خطر، اعرض العلامة نفسها على الطبيب الذي وصف الدواء. اسأله هل الجرعة الابتدائية تحتاج تعديل أو هل تعداد الدم يحتاج متابعة أكثر. النمط الجيني جزء واحد من قرار يعتمد على تشخيصك، وظائف الكلى والكبد، وتعداد الدم الحالي.
وش معنى TPMT في ملف 23andMe الخام؟
TPMT وNUDT15 يصنعان إنزيمات تشارك في معالجة أدوية الثيوبورين. TPMT يضيف مجموعة ميثيل إلى مستقلبات الثيوبورين ويعطلها. NUDT15 يزيل مجموعات الفوسفات من نيوكليوتيدات الثيوبورين النشطة، فيقلل مخزون الدواء النشط. أي متغير يقلل الوظيفة في أي من الجينين قد يضعف هذه القدرة على الكبح. هذا مهم فقط إذا كنت تأخذ دواء ثيوبورين. إذا ما تأخذ هذه الأدوية، النتيجة لا تغير حياتك اليومية.
البيانات الخام للمستهلك ليست نتيجة سريرية. شرائح المستهلك تفحص متغيرات مختارة فقط، وقد تفوّت متغيرات نادرة في TPMT أو NUDT15 تؤثر على نشاط الإنزيم. أي قرار دوائي يجب أن يكون مع طبيب، ومع اختبار دوائي جيني تأكيدي عند الحاجة.
شكل الأسطر في الملف الخام
سطر 23andMe بصيغة .txt يكون مفصولًا بـ tab، وغالبًا ينتهي بالنمط الجيني. سطر VCF يخزن الأليل المرجعي والبديل والنمط الجيني في حقل GT. السلسلة والاتجاه ونسخة الشريحة قد تؤثر على أي rsIDs موجودة وكيف تظهر النتيجة.
| نوع الملف | سطر المثال |
|---|---|
| 23andMe .txt | rs116855232 13 48608575 CT |
| VCF | 13 48608575 rs116855232 C T . . . GT 0/1 |
الإحداثيات حسب GRCh37/hg19، المستخدمة في كثير من ملفات 23andMe بصيغة .txt. إذا كان ملف VCF لديك يستخدم GRCh38، فقد يختلف الموضع. هذا المثال ليس ضمانًا أن شريحتك تشمل هذا الـ rsID؛ فقد تغيّر السلسلة والاتجاه ونسخة الشريحة ما يظهر في التقرير.
ليست كل نسخ 23andMe تشمل علامات TPMT وNUDT15. المثال أعلاه ليس ضمانًا أن هذه الـ rsIDs موجودة في ملفك. إذا كانت العلامة غير موجودة، فالفحص لم يقيّم هذا الموضع.
شكل النتائج منخفضة النشاط
إذا كانت العلامات موجودة، فالصورة أبسط مما توحيه أسماء النجوم. النتيجة الطبيعية في المواضع المفحوصة تعني أن هذه المواضع طبيعية فقط. وهذا ليس استبعادًا للمتغيرات النادرة أو المتغيرات غير الموجودة على الشريحة.
وجود أليل خطر واحد قد يشير إلى نشاط متوسط فقط إذا لم توجد متغيرات ممرضة أخرى وكان الـ haplotype أو الـ phasing صحيحًا. بيانات المستهلك الخام وحدها لا تؤكد النمط الظاهري لـ TPMT/NUDT15 أو أسماء النجوم. وجود أليلين خطرين في الجين نفسه قد يعني نشاطًا أقل، لكن البيانات الخام لا تؤكد إن كانا على كروموسومين متقابلين أو معطلين تمامًا.
| العلامة | لا يوجد أليل خطر | أليل خطر واحد | أليلان خطران |
|---|---|---|---|
| علامات TPMT إذا كانت موجودة، مثل rs1800462 أو rs1800460 أو rs1142345 | نشاط طبيعي في هذه المواضع | نشاط متوسط محتمل؛ قد ينظر الطبيب في تعديل الجرعة ومتابعة تعداد الدم حسب إرشادات CPIC والدواء المحدد | نشاط منخفض محتمل وخطر سمية مرتفع؛ قد يلزم فحص تأكيدي |
| NUDT15 rs116855232 (c.415C>T)، إذا كان موجودًا | C/C طبيعي | C/T نشاط متوسط محتمل | T/T نشاط منخفض محتمل وخطر سمية مرتفع |
Scroll the table sideways for the rest →
هذا دليل إرشادي فقط. وهو لا يضمن أن الشريحة تشمل هذه العلامات. وجود أليل خطر واحد قد يشير إلى نشاط متوسط فقط إذا لم توجد متغيرات ممرضة أخرى وكان الـ haplotype أو الـ phasing صحيحًا. البيانات الخام وحدها لا تؤكد أسماء النجوم أو النمط الظاهري. قرارات الجرعات يجب أن تتبع إرشادات CPIC.
الجرعة تعتمد على الدواء، المرض، ونتائج فحوصات أخرى. اتبع إرشادات CPIC للدواء المحدد.
الأنماط بين المجموعات السكانية
المتغيرات منخفضة النشاط في TPMT وNUDT15 ليست موزعة بالتساوي بين المجموعات السكانية. إرشادات CPIC تشير إلى أن NUDT15 c.415C>T أكثر شيوعًا في سكان شرق آسيا وأقل شيوعًا في مجموعات أخرى. أليلات TPMT منخفضة النشاط توجد في مجموعات كثيرة. هذه اتجاهات سكانية وليست تنبؤًا فرديًا. نتيجة TPMT الطبيعية ليست استبعادًا كاملًا. شخص من أصول شرق آسيوية ممكن تظهر نتيجة TPMT طبيعية على الشريحة ومع ذلك يكون نشاط NUDT15 منخفضًا، ويبقى خطر تأثر نخاع العظم قائمًا.
هل نتيجة TPMT الطبيعية تعني أن أدوية الثيوبورين آمنة؟
لا. النتيجة الطبيعية تغطي فقط المتغيرات الموجودة على الشريحة. متغيرات TPMT النادرة غير الموجودة على شريحة المستهلك قد تقلل النشاط أيضًا. يجب فحص NUDT15 بشكل منفصل. متابعة تعداد الدم تبقى أساسية لأن جرعة الدواء، وظائف الكلى، والتداخلات قد تسبب تثبيط نخاع العظم حتى مع نمط جيني طبيعي. الخطأ الشائع هو اعتبار النتيجة السلبية من فحص المستهلك المباشر استبعادًا كاملًا وتجاوز المتابعة.
خطوات تنزيل ملف 23andMe داخل الصفحة نفسها.
باختصار: وش يستاهل تسوي له شي.
إذا تبي تفحص هذه العلامات في ملفك من 23andMe أو AncestryDNA أو MyHeritage أو ملف VCF لجينوم كامل، HealthOS DNA يحلل الملفات الخام المدعومة داخل المتصفح. HealthOS يعرض الاستجابة للأدوية باستخدام إرشادات CPIC للجين والدواء. التقرير الكامل يفتح بعد رمز بريد إلكتروني يستخدم مرة واحدة. الخدمة لا تقدم تشخيصًا أو قرارًا سريريًا.
جديد على ملفات DNA الخام؟ ابدأ بالدليل الكامل: كيف تحلل ملف 23andMe الخام مجانًا
كتابة
فريق أبحاث HealthOS