هل إحنا أقارب؟ قارن بين ملفين خام لـ DNA
ملفات الـ DNA الخام لشخصين تقدر تبين مدى قربهم من بعض: كل ما تطابقت واسمات أكثر، كانت القرابة أقرب. ارفع الملفين تحت والأداة تحسب معامل القرابة بطريقة KING المنشورة وتحدد أقرب علاقة تناسب النتيجة، من كونهم نفس الشخص لين عدم وجود قرابة.
تشتغل في متصفحك. ما يطلع من جهازك أي شي تكتبه أو ترفعه.
وشلون يشتغل؟
Over the SNPs both files read on chromosomes 1-22: kinship = 1/2 − (hetA + hetB − 2·hetBoth + 4·opposite) / (4·min(hetA, hetB)) hetA, hetB = SNPs where each person has two different letters hetBoth = SNPs where both do, opposite = SNPs like AA vs GG (IBS0) > 0.354 same person or identical twin · 0.177-0.354 first degree · 0.088-0.177 second · 0.044-0.088 third · below unrelated First degree: almost no opposite SNPs (under 0.1 × what unrelated people show) = parent and child, else full siblings
معامل قرابة 0.5 يعني نفس الـ DNA، و0.25 للأب/الأم، الابن/البنت، أو الأخ الشقيق، و0.125 للأخ غير الشقيق، الجد/الجدة، العمة/الخالة، العم/الخوال، و0.0625 لابن العم/خال الدرجة الأولى. الثقة بالنتيجة تقل لما يكون عدد الـ SNPs المشتركة أقل، وأبناء العمومة من الدرجة الثالثة وما بعدها ممكن يظهرون كأنهم غير أقارب. هذي ليست فحص أبوة قانوني، وقارن الملفات فقط بإذن صاحبها.
المصادر
- Manichaikul A, Mychaleckyj JC, Rich SS, Daly K, Sale M, Chen WM. Robust relationship inference in genome-wide association studies. Bioinformatics 2010;26(22):2867-2873. doi:10.1093/bioinformatics/btq559
مثال محلول
الأرقام من المصدر، بعد ما مرت على هذه الأداة:
معامل القرابة: 0.250(إخوة أشقاء)
KING-robust eq. 11 by hand: 0.5 − (3000 + 3000 − 2×1700 + 4×100) / (4×3000) = 0.5 − 3000/12000 = 0.250 (1st degree, 0.177-0.354). IBS0 = 100/10000 = 1%; unrelated IBS0 ≈ 0.3×0.3/2 = 4.5%, ratio 0.22 ≥ 0.1 → full siblings
تقرير DNA مجاني
اقرأ ملف الـ DNA الخام كامل
الصحة، الأصول، الهابلوغروب وغيرهم من ملف 23andMe أو AncestryDNA أو MyHeritage حقك، وكل القراءة تصير في متصفحك.
افتح تقرير الـ DNA المجانيما عندك ملف DNA خام بعد؟
اطلب طقم HealthOS للـ DNA: ابصق في الأنبوب في بيتك، وأصولك وسلالاتك وصفاتك توصل حسابك في HealthOS مع الملف الخام.
شوف طقم الـ DNAأسئلة
- هل أقدر أقارن بين ملفين للحمض النووي الخام عشان أشوف إذا كنا أقارب؟
- أي نعم. نزّل البيانات الخام لكل شخص من شركة فحص الحمض النووي حقه، واسحب الملفين فوق. الأداة تقارن نقاط الاختلاف الوراثية (SNPs) اللي موجودة في الملفين الاثنين وتحسب كم نسبة الحمض النووي المشتركة بينهم.
- وش هو معامل القرابة (kinship coefficient)؟
- هو احتمال إن حرف واحد من الحمض النووي مأخوذ من شخص، ونفس المكان مأخوذ من الشخص الثاني، يكونوا ورثوه من جد مشترك. النسبة تكون 0.5 لنفس الشخص، و0.25 للأب/الأم أو الأخ الشقيق، و0.125 للأخ غير الشقيق، وتقريباً صفر للأشخاص اللي ما بينهم قرابة. ضعف قيمة المعامل يعطي تقريباً نسبة الحمض النووي المشترك.
- إذا كانت مطابقة الحمض النووي 25%، هل يعني هذا إننا إخوة غير أشقاء؟
- حوالي 25% من الحمض النووي المشترك (قرابة قريبة من 0.125) تعني درجة قرابة ثانية. الإخوة غير الأشقاء، الجد والحفيد، والخالة أو العم مع ابنة الأخ أو ابن الأخت كلهم يتشاركون هالنسبة تقريبًا، فمقارنة الـ DNA لحاله ما تقدر تفرّق بينهم. العمر وتاريخ العائلة يساعدون.
- كيف تفرّق الأداة بين الأب والابن وبين الأخوين الشقيقين؟
- الاثنين يتشاركون حوالي نصف الحمض النووي. لكن الأب والابن يتشاركون على الأقل حرف واحد في كل نقطة اختلاف (SNP)، فما تظهر أزواج متعاكسة مثل AA مقابل GG إلا نادراً جداً. أما الإخوة الشقيقون ففيهم مواقع ما ورثوا فيها شي مشترك، فتظهر بعض الأزواج المتعاكسة.
- هل أقدر أقارن بين ملفات من شركات مختلفة؟
- أي نعم، لكن الشركات المختلفة تفحص نقاط اختلاف (SNPs) مختلفة، فعدد النقاط اللي تتطابق يقل والدقة تنزل. أفضل النتائج تجيك لما تقارن ملفات من نفس الشركة، أو نفس إصدار الرقاقة المستخدمة.
- هل هذا اختبار أبوة رسمي؟
- لا. هذه مقارنة مجانية بين ملفين خاميين، وهي مو اختبار أبوة قانوني أو قضائي. المختبرات اللي تسوي اختبارات رسمية تتحقق من هوية صاحب العينة بنفسها.
للمعلومات فقط. هذي مو نصيحة طبية ولا تشخيص. راجع دكتور إذا فيه نتيجة تقلقك.